سفرى كه به حج بيت اللّه مشرف شده در ضمن ديگر آثارش مفقود شده است . 2 - شرح فارسى بر شافيه ابن حاجب كه ناتمام مانده و مفقود شده است . 3 - شرح بزرگى بر الفيه ابن مالك كه ناتمام مانده است و در اين شرح به يادآورى از مناقشاتى كه با ملا جامى داشته است ، پرداخته و نيز مفقود شده است . 4 - شرح متوسط ديگرى بر الفيه ابن مالك ، اين شرح را در اوايل بلوغش تدوين كرده است و در هنگام مراجعت از اولين سفر حجش همراه با كتاب‌ها و پاره‌اى از مؤلفات و تعليقاتش كه جمعا يك‌صد مجلد كتاب مىشد به انضمام اموالى كه همراه داشته ، مفقود شده است . 5 - حواشى بر شرح مختصر الاصول و متعلقات آنكه ناتمام مانده است . 6 - حواشى بر تهذيب الحديث كه به اتمام نرسيده است . 7 - حواشى بر مختلف علامه كه ناتمام مانده است . 8 - حواشى بر من لا يحضره الفقيه كه برخى از اين حواشى به طور مجزا جمع‌آورى شده و بعضى از آن‌ها بر حواشى كتاب باقى مانده است . 9 - حواشى بر آيات الاحكام شيخ جواد كاظمى شاگرد شيخ بهايى . 10 - تعليقاتى بر حاشيه قديمه جلاليه . 11 - تفسير فارسى سوره واقعه كه در ضمن تفسير اين سوره به بخشى از اخبار واردهء مربوط به آن سوره اشاره كرده است . 12 - بساتين الخطباء كه به نام عونة الخطيب و يا رياض الازهار و يا رياحين القدس ناميده مىشود اين كتاب در سه مجلد تأليف شده است و